Постоянная экспозиция:
Зал природы
Зал палеонтологии
Зал археологии, истории города Алатыря, Алатырского уезда и истории религии с интерьерами «Келья монаха» и «Крестьянская изба»
Зал развития торговли в г. Алатыре на рубеже 19-20 вв. с интерьерами: «Ломбард»; «Аптека»; «Бакалейный магазин»; «Книжный магазин».
Зал истории Великой Отечественной войны, посвященный алатырцам – участникам войны и труженикам тыла.
Выставочные залы:
Исторический отдел
ул. Московская, 23
Выставочный зал площадью 85 кв. метров, оснащенный современным витринным оборудованием, позволяет привлекать посетителей на разнообразные выставки, организуемые на основе фондов нашего музея, других музеев и частных коллекций.
Отдел изобразительных искусств
ул. Комсомола, 47
Выставочный зал площадью 68 кв. м.
Выставочный зал площадью 54 кв. м
В двух выставочных залах демонстрируются произведения живописи, графики и декоративно-прикладного искусства. Регулярно проводятся персональные выставки алатырских художников.
А также памятные выставки с показом документов и фотографий, посвященные деятелям художественной культуры.